邓子基的第一届博士生是1985年入学的，有董大胜、巫克飞、葛南翔3位。当时，“比较财政学”是一个新领域，尚缺乏这方面的专著或教材。为了培养学生的学术实践能力，邓子基带着他们编写《比较财政学》一书。当时，董大胜和葛南翔会俄语，巫克飞会英语，邓子基让学俄语的重点研究苏联财政，而学英语的则重点研究英美财政。董大胜回忆说：“作为博士生，能有机会参与前沿书籍的编写，其锻炼作用可想而知，我们分工协作，夜以继日，最终拿出了一部让老师满意的作品，也开启了一扇全面学习研究国外财政学的窗户。”

邓子基的课深入浅出、环环紧扣，不仅旁征博引、循循善诱、恰到好处，而且妙语连珠、幽默诙谐、寓教于乐。学生们都说，来邓子基家中听课，每次都不觉得是在完成学习任务，而是一种快乐。邓子基虽然上了年纪，但思维依旧活跃，他的创作欲望强烈，不断钻研新的财政经济问题，接受新的知识和思想。他接手课题时，会构思基本观点和方法，从传统的财政理论研究出发，然后让学生在观点的基础上进行发挥。他常说“中为体、洋为用”，支持大家多引进西方的有益观点、学习西方;同时要注意让西方理论与中国现实经济制度变迁融为一体。

对于学生们的论文，邓子基每篇都会仔细地修改。邓子基指导论文注重两个方面：一个是逻辑，一个是标点与格式。他给学生修改论文一般用红笔，如果有不理解的或者有歧义的话，就会圈起来，并在这一页纸的下方提问，如“你写的这段话是值得商榷的”等。有的时候学生写的语句比较绝对或者主观，邓子基觉得实际中未必是这样，也会做出标记。邓子基不会故意给自己的学生增加压力和负担，改好了觉得比较理想的话，会帮学生向期刊推荐发表。“我的博士论文当时交给老师帮我修改，说两个星期后帮我改好。两个星期后我去他家，论文上面密密麻麻的将近贴了一百多张纸条，每一张上面都写着修改意见。勾勾圈圈，一字一句都详细地修改，连标点符号都要改过来。”邓子基的学生方东霖博士如是说。他认为，跟邓子基学习时打下的学术和写作功底格外扎实。

由于邓子基在学界的名望高，很多出版社都会找他出教科书。例如，邓子基在高等教育出版社出版了《财政学》(起初开始叫《社会主义财政学》)，该书写得比较通俗易懂，主要针对在职学生或者是211院校以下的学生。邓子基给出框架，根据学生所学专长进行人员分工，分派任务，各自完成后再由他整合。经济学书籍讲究逻辑性，由于各个老师的知识结构、文笔文风各有异，整合的过程有时比写作还要艰难。

邓子基不仅对知识追求有强烈的热情，对学生也是慈父般深沉地关爱。每一个学生也都把他当作心中的慈父。邓子基对膝下学子极富包容心。他的学生中有普通全日制的统考生，也有在职生。在职业方面，无论是学生的来源和工作背景，还是毕业后的职业选择，如从政、从教、从商，他都很包容。邓子基常说，“人各有志、人贵有志”，大家都要有所作为。

邓子基的学生林致远教授介绍说，邓子基的师门是一个大家庭，也是一个大平台，大家可以充分利用这个平台的学识、资源，发挥自己的才学，获取新的知识，在自己的岗位上作出贡献。邓子基不仅在从教上以身作则，在做人上也以身作则，他是一个好人，并且时时做一个好人。

邓子基的学生，曾多年担任商务部新闻发言人、政策研究室主任、国际贸易谈判局局长的沈丹阳每次从北京回厦门总要抽空到家里探望邓子基，向邓子基报告学习工作情况。得知邓子基保存的相片中还有不少他亲自从电视上抓拍的自己作为发言人的精彩瞬间时，沈丹阳热泪盈眶!很多学生虽然毕业多年，但是在工作、生活、事业上有什么好消息，第一时间都会告诉邓子基。而邓子基每接到学生的一个好消息，都会高兴许久。

现在财政部工作的承皓博士，曾经师从邓子基攻读硕士和博士，当时她的家在新疆，由于路途遥远，只有暑假可以回家。寒假中的每一个春节她都是在邓子基家里度过的。回忆起来，她至今还充满感激。

诗人艾青有一句非常著名的诗：“为什么我的眼里常含泪水?因为我对这土地爱得深沉。”邓子基对学生、对三尺讲台爱得也是那么深沉……

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